История Карагандинского филиала начинается с 1938 года, с образования в Караганде отдела мер и весов с подчинением Управлению Наркомата внутренних дел Казахской ССР, коллектив которого состоял из 10 человек. Сегодня филиал насчитывает 97 человек. Филиал аккредитован в системе аккредитации Республики Казахстан и имеет в своём составе:

• орган по подтверждению соответствия продукции и услуг АО «НаЦЭкС»;
•  испытательный центр;
• орган по подтверждению соответствия систем менеджмента АО «НаЦЭкС»;
• метрологическую службу;
• службу стандартизации.